Tổng quan

Xét nghiệm gen 70 cho ung thư dạ dày là một bảng xét nghiệm thế hệ mới kết hợp hóa trị và giải trình tự gen MSI/MMR, được thiết kế để lập bản đồ phân tử của khối u cá thể. Giá trị thực sự của nó nổi lên khi bảng xét nghiệm này được kết hợp với các chẩn đoán đi kèm thay vì đọc riêng lẻ. Bài viết này giải thích cách các phòng thí nghiệm và đội ngũ ung thư tích hợp báo cáo gen 70 với các xét nghiệm trực giao để hướng dẫn quyết định điều trị, biến danh sách các biến thể dài thành kế hoạch điều trị mà đội ngũ chăm sóc có thể tin tưởng. Trong thực hành thông thường, quy trình làm việc kết hợp này cắt giảm số lượng xét nghiệm riêng biệt mà bệnh nhân phải thực hiện và cung cấp cho hội đồng khối u phân tử một cơ sở bằng chứng phối hợp để thảo luận, giúp rút ngắn con đường từ sinh thiết đến lựa chọn điều trị có lý.

Tại sao kết hợp NGS với IHC và FISH

NGS vượt trội trong việc phát hiện các thay đổi trình tự trên nhiều gen cùng lúc, nhưng việc xác nhận ở cấp độ protein vẫn có giá trị. Ví dụ, tình trạng thụ thể yếu tố tăng trưởng biểu bì ở người loại 2 (HER2) thường được đánh giá bằng hóa mô miễn dịch (IHC) và lai tại chỗ (FISH), và bảng gen 70 bổ sung chứ không thay thế quy trình làm việc đó. Kết hợp các phương pháp làm giảm nguy cơ chẩn đoán sai âm tính có thể dẫn đến việc bỏ lỡ một lựa chọn điều trị đích phù hợp, và nó giải quyết các kết quả xét nghiệm đơn lẻ không rõ ràng thông qua bằng chứng trực giao.

Đối sánh kết quả với các lựa chọn điều trị đích và hóa trị

Bảng xét nghiệm báo cáo các thay đổi liên quan đến các tác nhân đích và các dấu ấn liên quan đến độ nhạy hóa trị, cộng với tình trạng MSI/MMR. Kết quả microsatellite không ổn định (MSI-H) hoặc thiếu hụt sửa chữa bắt cặp (dMMR) có thể cho thấy đủ điều kiện để ức chế điểm kiểm soát miễn dịch theo nhãn đã được phê duyệt, trong khi các thay đổi khác chỉ ra các lựa chọn thử nghiệm lâm sàng. Việc trình bày kết quả NGS cùng với tóm tắt chẩn đoán đi kèm rõ ràng giúp các bác sĩ điều trị chuyển từ dữ liệu sang một phác đồ cụ thể với lý do được ghi nhận.

Xây dựng quy trình báo cáo kết hợp

Một quy trình làm việc thực tế kết hợp báo cáo giải trình tự với một phần đi kèm có cấu trúc: kết quả IHC/FISH đã xác nhận, kết quả MSI/MMR và danh sách các biến thể được tuyển chọn có liên quan đến liệu pháp hoặc thử nghiệm. Các phòng thí nghiệm nên chuẩn hóa thời gian hoàn thành và đánh dấu rõ ràng các biến thể có ý nghĩa không xác định để các bác sĩ lâm sàng không bị hiểu sai. Việc tích hợp như vậy biến danh sách gen độc lập thành một bản đồ điều trị có thể hành động và rút ngắn con đường từ sinh thiết đến lựa chọn liệu pháp có thông tin.

Câu hỏi thường gặp

H: Bảng gen 70 có thay thế xét nghiệm HER2 bằng IHC không? Đ: Không. Đánh giá HER2 ở cấp độ protein bằng IHC và lai tại chỗ vẫn là tiêu chuẩn; bảng gen bổ sung cho nó bằng cách thêm ngữ cảnh di truyền.

H: Tình trạng MSI/MMR bổ sung những gì về mặt lâm sàng? Đ: Kết quả MSI-H hoặc dMMR có thể cho thấy đủ điều kiện để điều trị bằng thuốc ức chế điểm kiểm soát miễn dịch theo nhãn đã được phê duyệt và là một phần của quy trình sàng lọc ung thư dạ dày tiêu chuẩn.

H: Các biến thể có ý nghĩa không xác định nên được xử lý như thế nào? Đ: Chúng nên được báo cáo một cách minh bạch và không được sử dụng đơn lẻ để lựa chọn liệu pháp; cần có sự xác nhận và tương quan lâm sàng.